Pääjohtaja ja johdon tuki
Tarkastusvirastoa johtaa eduskunnan valitsema pääjohtaja, jonka toimikausi kestää kuusi vuotta. Pääjohtajana toimikaudella 1.1.2007 – 31.12.2012 toimii Tuomas Pöysti.
Oikeustieteen tohtori Tuomas Pöysti on toiminut valtiovarainministeriössä budjettiosaston hallitussihteerinä vuosina 1999–2000, valtiovarainministeriön neuvottelevana virkamiehenä 2000–2004 sekä hallinto-oikeuden dosenttina Helsingin yliopistossa 2001 vuodesta lähtien. Hän on parhaillaan virkavapaalla valtioneuvoston controllerin virasta, jossa hän on toiminut vuosina 2004–2006.
Johdon tuen tehtävänä on avustaa pääjohtajaa tarkastusviraston johtamisessa sekä viraston toiminnan suunnittelussa, kehittämisessä ja seurannassa sekä johtaa eduskunnalle annettavien kertomusten ja lausuntojen valmistelua. Johdon tuki vastaa kansan- ja valtiontalouden strategisesta riskianalyysistä ja riskiraportoinnista sekä osallistuu finanssipolitiikan tietoperustan ja vaikuttavuuden tarkastukseen. Johdon tukeen kuuluu seitsemän henkilöä. Johdon tukea johtaa esikuntapäällikkö Tytti Yli-Viikari (vv), sijaisena toimii vs. esikuntapäällikkö, KHT, JHTT Marko Männikkö. Esikuntapäällikköä avustaa johdon tuen apulaispäällikkö, KTT Tanja Tanayama.